Convenio Marco de Cooperación Centro Cochrane Iberoamericano para el Desarrollo de un Nodo.
Se incorporó como Nodo dependiente del IIE el Hospital Privado Centro Médico de Córdoba como Centro Adherido de la Red Cochrane Iberoamericana. Firmado el 27 de Agosto de 2009.

Convenio Marco de Cooperación con la Universidad Nacional del Sur.
Renovación firmada el 26 de Abril de 2006. Duración 2 años. Renovación automática.

Convenio Marco de Cooperación con el Centro de Estudios de Estado y Sociedad (CEDES).
Firmado el 8 de Marzo 2007. Duración 2 años. Renovación automática

Convenio Marco de Cooperación Técnica con el Hospital de Pediatría S.A.M.I.C. "Prof. Dr. Juan P. Garrahan"
Firmado 30 de Octubre de 2008.- Duración 1 año. Renovación automática

Convenio Marco de Cooperación con la Sociedad Argentina de Pediatría
Firmado el 28 de Agosto de 2007

Convenio Marco de Cooperación con la Sociedad Argentina de Emergencias
Firmado 30 de Diciembre de 2008. Duración 2 años. Renovación automática.

Convenio con la Secretaría de Programación para la Prevención de la Drogadicción y la Lucha contra el Narcotráfico de la Presidencia de la Nación
Firmado el 29 de Diciembre de 2008 - 1 año

Convenio marco de cooperación con el Colegio mexicano de especialistas en ginecología y obstetricia
Firmado el 3 de setiembre de 2009 - 1 año

Convenio Marco de Cooperación con el Ministerio de Salud y Ambiente de la Nación
Convenio Específico Nº 1. Firmado el 20 de Marzo de 2006. Duración 1 año.

Convenio Marco de Cooperación con el Ministerio de Salud y Ambiente de la Nación
Convenio Específico Nº 2. Firmado el 15 de Diciembre de 2006. Duración 1 año

Convenio de Cooperación Técnica con BAXTER IMMUNO S.A.
Firmado el 31 de mayo de 2007. Duración 1 año.

Convenio de Cooperación Técnica con la Sociedad Argentina de Dermatología.
Firmado el 23 de octubre 2007. Duración 1 año.